Les loges apposaient leur sceau sur les courriers et sur les diplômes et attestations remis à leurs frères pour leur permettre de faire reconnaître leur qualité maçonnique.
Avec le concours de la Bibliothèque Nationale le musée peut proposer les copies de sceaux de loges anciennes. Le plus ancien est celui de la loge "Saint-Julien" de Brioude et date du 6 novembre 1744; le plus récent qu'elle possède et que nous avons reçu est celui des "Philanthropes Arvernes" de Clermont-Ferrand de 1901.
Le musée possède aussi d'autres sceaux et un moulage représentant une médaille des Chevaliers du Temple.