A la fin du 19ème siècle, et notamment pendant l'affaire Dreyfus, les mouvements anti républicains visent également la franc-maçonnerie. Au début du 20ème siecle l'affaire des fiches est largement utilisée par ceux qui combattent le Grand Orient de France. Après la loi de séparation des Eglises et de l’Etat de 1905, des manifestations, souvent violentes, sont motivées par les inventaires des édifices du culte.
L'antimaçonnisme a le plus souvent recours à la caricature et les écrits mentionnent de plus en plus le complot maçonnique qui serait associé au complot juif, avec une virulence qui va perdurer jusqu'à la deuxième guerre mondiale, durant laquelle on attribuait aux "forces occultes judéo-maçonniques" d'avoir favorisé le chaos et la misère en Europe.